Parazitismus
Netopýři jsou hostiteli ektoparazitů, jako jsou netopýří mušky a křídlatí roztoči, kteří se živí jejich krví a mohou přenášet nemoci. Tito paraziti mohou způsobit ztrátu krve, infekce, změny v chování a zatěžovat imunitní systém. Nedávné studie však zpochybňují, do jaké míry netopýři těmito parazity skutečně trpí. Netopýři jsou také nositeli virů, včetně koronavirů přenosných na zvířata nebo lidi.